在南京办理港澳通行证，可以参照以下步骤和所需材料：
准备材料
身份证原件及复印件。
户口簿原件及复印件。
复印件需要是A4规格，身份证复印正反面，户口簿复印户主页和本人所在页。
二寸正面免冠平面彩色近照，白色背景，着深色有领上衣，照片大小48x33mm，头部宽度21-24mm，头部长度28-33mm。
如果是全额发票原件及复印件（如果你户口所在的城市开通港澳自由行，则不需要此项）。
选择办理方式
可以选择网上预约，进入南京公安微信公众号，点击下方微服务，选择出入境，预约申请，填写相关信息，完成预约后可以代他人预约。
也可以直接到南京市公安局出入境管理局领取淡绿色的港澳通行证办理申请表，或者从南京市公安局出入境管理局网站下载打印。
提交申请
携带上述材料，前往你户口所在地的公安局出入境管理部门办理，不能委托他人代办，也不能异地办理。
如果是首次申请，且年满16周岁，仅需携带身份证即可。
未满16周岁的未成年人，需要由监护人陪同申请，并提交监护人的相关身份证明。
缴纳费用
工本费100元，签注1次有效20元（选择2次有效则40元），拍照和快递费用大概50元左右。
办理时限
一般需要15个工作日。
受理后可在南京公安微信平台上自助查询办理进度。
其他注意事项
有些人员如副处以上领导、涉密人员等需要单位审批。
填写申请表时，需要按照户口本和身份证上的信息填写，新办时勾选“港澳通行证”，目的地可以香港澳门均勾选。
提交申请后，需要拿回执，这是领取通行证的凭证。
建议提前准备好所有材料，选择合适的办理方式，提前预约，以确保顺利办理港澳通行证。
